El plan de estudios del Modelo Pedagógico Pensar® se desarrolla así:
a) para el nivel de secundaria en dos años lectivos, es decir, 6° y 7° en un año, 8° y 9° en un año.
b) Para el nivel de educación media (10° y 11°) en un año.
Durante estos periodos se abordan las competencias previstas en los referentes de calidad educativa del Ministerio de Educación Nacional.